Login for students

Login for employees

Publication detail

Detection of Fusarium using the PCR Method
Authors: Zachová Iveta | Vytřasová Jarmila | Sobodová Lucie | Červenka Libor
Year: 2005
Type of publication: článek ve sborníku
Name of source: Natural Sciences
Publisher name: University of Miskolc
Place: University of Miskolc
Page from-to: 417-423
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Detekce fusárií metodou PCR Byly optimalizovány dvě metody. Jednak postup extrakce DNA dle Cenise (1992) a postup PCR dle Edwardse et al. (2001), jednak byl pro izolaci DNA a její následnou amplifikaci použit komerční set určený pro izolaci a amplifikaci genomické DNA z listů rostlin. Použití komerčního setu se pro detekci toxinogenních plísní rodu Fusarium jeví jako spolehlivější a rychlejší. Pro optimalizaci a stanovení citlivosti reakce byla použita sbírková kultura F. graminearum CCM F ? 683. Selektivita metody byla ověřena na sbírkových kulturách plísní, které se mohou vyskytovat v reálných vzorcích potravin společně s plísněmi rodu Fusarium. Polymerasová řetězová reakce byla použita pro sledování přítomnosti Tri5 genu kódujícího tvorbu trichothecenových mykotoxinů. Bylo vyšetřeno 50 vzorků potravin a krmiv. Sedm z nich bylo pozitivních na přítomnost plísní rodu Fusarium. Pět druhů rodu Fusarium vyizolovaných ze vzorků obsahovalo v DNA Tri5 gen. U jednotlivých sbírkových plísní i plísní získaných ze vzorků byly rovněž sledovány makroskopické a mikroskopické morfologické znaky na různých živných médiích. Morfologické znaky jsou důležité pro druhové určení rodu Fusarium, metodou PCR pak lze odlišit toxinogenní druhy od netoxinogenních. Polymerasová řetězová reakce představuje značné urychlení detekce toxinogenních plísní rodu Fusarium. Pomocí PCR jsme schopni detekovat toxinogenní fusaria během 48 hodin, zatímco jejich zjištění na základě morfologických znaků trvá dva až tři týdny. Technika PCR se osvědčila jako spolehlivý a rychlý způsob detekce toxinogenních plísní rodu Fusarium. Fusarium graminearum; toxigenní plísně; PCR; trichotheceny
eng Detection of Fusarium using the PCR Method Two methods of isolation of DNA were evaluated for successful identification of Fusarium species. The PCR was performed using primer specifically targeted to Tri5 gene. Extraction technique of DNA by Cenis (1992) and PCR procedure according to Edwards et al. (2001) was compared with DNA isolation and amplification using Plant PCR Kit. Sensitivity of the latter method was determined using reference strain of Fusarium graminearum CCM F?683 and selectivity was examined using reference cultures of different genera of fungi naturally occurred in food and feedstuff. Morphological features are important for species classification whereby PCR can distinguish between toxigenic and non?toxigenic fungi of Fusarium. These fungi could be detected within 2 days, while their identification by macroscopic and microscopic features takes 2?3 weeks. Thus the PCR technique has proved itself as reliable and rapid method for detection of toxigenic species of Fusarium. Fusarium graminearum; toxigenic fungi; PCR; trichothecenes

Departments

Other Parts

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives