Skip to main content

Login for students

Login for employees

Publication detail

Outliers detection in the statistical accuracy test of a pK(a) prediction
Authors: Meloun Milan | Bordovská Sylva | Kupka Karel
Year: 2010
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: Journal of Mathematical Chemistry
Publisher name: Springer
Page from-to: 891-909
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Detekce odlehlých hodnot testem správnosti u predikcí pKa Regresní algoritmus REGDIA v S-Plus je předložen k analýze správnosti pKa, které se predikuje čtyřmi programy: PALLAS, Marvin, Perrin a SYBYL. Na základě statistické analýzy reziduí a regresní diagnostiky jsou provedeny testy správnosti. Analýza je založena na vyšetření těsnosti proložení pomoci grafických diagnostik 15 pomůcek analýzy dat. Odlehlé hodnoty pKa se týkají molekul, které jsou špatně charakterizovány. Z nejúčinnějších pomůcek jsou užity Williams graf, graf predikované zbytků, Pregibon graf, Gray L-R graf a šest statistických charakteristik, Fexp, R2, R2P, MEP, AIC. Navržená zkouška přesnosti programu REGDIA může také být rozšířena na zkoušku další předpovězené hodnoty, jako jsou log P, log D, rozpustnost ve vodě nebo některé fyzikálně-chemické vlastnosti. Detekce odlehlých hodnot; test správnosti pKa; predikce pKa
eng Outliers detection in the statistical accuracy test of a pK(a) prediction The regression diagnostics algorithm REGDIA in S-Plus is introduced to examine the accuracy of pKa predicted with four programs: PALLAS, MARVIN, PERRIN and SYBYL. On basis of a statistical analysis of residuals, outlier diagnostics are proposed. Residual analysis of the ADSTAT program is based on examining goodness-of-fit via graphical diagnostics of 15 exploratory data analysis plots. Outliers in pKa relate to molecules which are poorly characterized by the considered pKa program. Of the seven most efficient diagnostic plots (the Williams graph, Graph of predicted residuals, Pregibon graph, Gray L–R graph, The six statistical characteristics, Fexp, R2, R2P, MEP, AIC, and s in pKa units. The proposed accuracy test of the REGDIA program can also be extended to test other predicted values, as log P, log D, aqueous solubility or some physicochemical properties. pKa prediction; Dissociation constants; Outliers; Residuals; Goodness-of-fit; Williams graph