Login for students

Login for employees

Publication detail

Comparison of Methods for Isolating Fungal DNA
Authors: Moťková Petra | Vytřasová Jarmila
Year: 2011
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: Czech journal of food sciences
Publisher name: Česká akademie zemědělských věd
Place: Praha
Page from-to: 76-85
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Porovnání různých metody izolace plísňové DNA V této studii byly optimalizovány a porovnávány metody izolace a imobilizace DNA. Cílem izolačních postupů bylo získat DNA o dostatečné kvalitě a kvantitě potřebné pro její amplifikaci, neboť většina technik vyžaduje amplifikaci DNA před její vlastní detekcí. Za tímto účelem byly porovnávány a optimalizovány klasické postupy extrakce DNA s izolacemi pomocí komerčních souprav. Metody byly hodnoceny z několika hledisek, důraz byl kladen hlavně na to, aby vyizolovaná DNA neobsahovala PCR inhibitory, které by bránily amplifikaci DNA, a tudíž by znemožňovaly vlastní detekci. Pro optimalizaci jednotlivých metod byly použity sbírkové kmeny rodu Aspergillus. Po vyhodnocení byly vybrány dvě nejvhodnější metody pro zpracování vzorků pozitivních na přítomnost potenciálně aflatoxinogenních plísní. Jednalo se o použití kitu pro izolaci DNA z listů rostlin od firmy Sigma a metodu dle Cenise s rozrušením mycelia pomocí kapalného dusíku. DNA plísní;DNA izolace;PCR;Aspergillus
eng Comparison of Methods for Isolating Fungal DNA The aim of the isolation processes was to obtain DNA of sufficient quality and quantity necessary for its amplification, as most detection techniques require DNA amplification before the proper DNA detection itself. For this purpose, classic methods of DNA extraction were compared and optimised while isolations using commercial kits were also done. The methods were evaluated from several perspectives, with focus especially laid on the isolated DNA not contain PCR inhibitors which would prevent DNA amplification, thus inhibiting the detection itself. For optimising the individual methods, collection strains of the genus Aspergillus were used. After the evaluation, two most suitable methods were selected and chosen for isolating potentially aflatoxigenic moulds taken from food samples. These methods were the commercially supplied kit for isolating DNA from plant leaves from Sigma and a classic method according Cenis in combination with the cell wall disruption by means of liquid nitrogen. fungal DNA;DNA isolation;PCR;Aspergillus

Departments

Other Parts

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives