University of PardubiceFaculty of Chemical Technology

University

Employees
|
Students
Česky

Publication detail

Lipidomická diferenciace nádorové tkáně prsu a sousední normální tkáně pomocí LC/MS, MALDI-MS a vícerozměrné statistické analýzy

Authors: Holčapek Michal | Cífková Eva | Lísa Miroslav | Chagovets Vitaliy Viktorovich | Vrána David | Gatěk Jiří | Melichar Bohuslav

Year: 2014

Type of publication: ostatní do riv

Page from-to: nestránkováno

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Lipidomická diferenciace nádorové tkáně prsu a sousední normální tkáně pomocí LC/MS, MALDI-MS a vícerozměrné statistické analýzy	Komplexní lipidomický přístup pro analýzu nádorové tkáně prsu a sousední normální tkáně je založen na kombinaci analytických dat získaných pomocí chromatografie hydrofilních interakcí (Hydrophilic interaction liquid chromatography, HILIC) ve spojení s hmotnostní spektrometrií (Mass spectrometry, MS) pro kvantifikaci tříd lipidů, ionizace a desorpce laserem na účasti matrice (Matrix-assisted laser desorption/ionization, MALDI) ve spojení s hmotnostním spektrometrem orbitrap s ultravysokým rozlišením a přesným určením m/z. Všechna naměřená data pro 10 pacientů byla statisticky vyhodnocena pomocí vícerozměrných statistických metod (Orthogonal 2 projections to latent structures, O2PLS). Mezi vzorky nádoru a sousedních normálních tkání byly nalezeny statisticky významné rozdíly, takže na základě lipidomické analýzy pomocí hmotnostní spektrometrie lze rozlišit nádorové tkáně pro rakovinu prsu a normální tkáně. V nádorové tkáni je pozorován výrazný nárůst koncentrace několika tříd lipidů, jako např. fosfatidylinositoly (PI), fosfatidylethanolaminy (PE), fosfatidylcholiny (PC) a lysofosfatidylcholiny (LPC). Dále dochází také ke změně koncentračních profilů uvnitř jednotlivých skupin fosfolipidu. Výrazný pokles koncentrace je pozorován pro ether- a vinyl- (plazmalogeny) lipidy pro PE, ale nikoliv pro PC.
eng	Lipidomic differentiation between human breast cancer and surrounding normal tissues using LC/MS, MALDI-MS and multivariate data analysis	The complex lipidomic approach for the differentiation of human breast cancer and surrounding normal tissues is based on the combination of analytical data from hydrophilic interaction liquid chromatography coupled with mass spectrometry, matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) mass spectrometry and multivariate data analysis using orthogonal 2 projections to latent structures (O2PLS).	breast cancer; LC/MS; MALDI-MS