Publication detail

Lipidomic differentiation between human kidney tumors and surrounding normal tissues using HILIC-HPLC/ESI-MS and multivariate data analysis

Year: 2015

Type of publication: článek v odborném periodiku

Name of source: Journal of Chromatography B

Publisher name: Elsevier Science BV

Place: Amsterdam

Page from-to: 14-21

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Rozdíly ve složení lipidů mezi lidskou nádorovou tkání a okolní normální tkání ledvin pomocí HILIC-HPLC/ESI-MS	Popis rozdílů lipidů mezi nádorovou tkání a okolní normální tkání dvaceti pacientů nádoru ledvin pomocí hydrofilní interakční kapalinové chromatografie (HILIC) a hmotnostní spektrometrie s ionizací elektrosperejem (ESI-MS). HILIC/ESI-MS metoda umožnila popsat více než 120 lipidů obsahujících různé acyly mastných kyselin lišící se délkou acylového řetězce a počtem dvojných vazeb. Vícerozměrná statistická metoda pomocí nesupervizované metody hlavních komponent (PCA) a supervizované metody nejmenších čtverců (OPLS) pomohla identifikovat statisticky nejvýznamnější rozdíly lipidů v nádorové a okolní normální tkáni.
eng	Lipidomic differentiation between human kidney tumors and surrounding normal tissues using HILIC-HPLC/ESI-MS and multivariate data analysis	The characterization of differences among polar lipid classes in tumors and surrounding normal tissues of 20 kidney cancer patients is performed by hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) coupled to electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS). The detailed analysis of identified lipid classes using relative abundances of characteristic ions in negative- and positive-ion modes is used for the determination of more than 120 individual lipid species containing attached fatty acyls of different chain length and double bond number. Lipid species are described using relative abundances, providing a better visualization of lipidomic differences between tumor and normal tissues. The multivariate data analysis methods using unsupervised principal component analysis (PCA) and supervised orthogonal partial least square (OPLS) are used for the characterization of statistically significant differences in identified lipid species. Ten most significant up- and down-regulated lipids in OPLS score plots are also displayed by box plots. A notable increase of relative abundances of lipids containing four and more double bonds is detected in tumor compared to normal tissues.	Lipidomics; Kidney cancer; Glycerophospholipids; HILIC-HPLC/ESI-MS; Multivariate data analysis

Search

Login for students

Login for employees

Publication detail

Departments

Other Parts

Map

Services

Popular Links