University of PardubiceFaculty of Chemical Technology

University

Employees
|
Students
Česky

Publication detail

Lipidomická analýza vzorků renálního karcinomu s využitím MALDI-Orbitrap-MS metody

Authors: Jirásko Robert | Khalikova Maria | Cífková Eva | Vrana David | Študent Vladimír | Melichar Bohuslav | Holčapek Michal

Year: 2016

Type of publication: ostatní - přednáška nebo poster

Page from-to: nestránkováno

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Lipidomická analýza vzorků renálního karcinomu s využitím MALDI-Orbitrap-MS metody	Karcinom z renálních buněk (RCC) je nejrozšířenější typ rakoviny ledvin. Incidence tohoto typu onemocnění v posledních letech vzrostla a Česká republika patří ke státům, ve kterých je v celosvětovém měřítku výskyt RCC nejvyšší. Zvýšená incidence je připisována stávajícím diagnostickým metodám, zejména ultrazvuku a výpočetní tomografii. I přesto patří RCC mezi nejletálnější urologické maligní onemocnění a je tedy nutné, aby současné postupy směřovaly k detekci počátečních stadií nádoru, při kterých ještě nedochází k metastázím do dalších orgánů. Důležitou úlohu v objasnění metabolismu nádorových onemocnění představují rozsáhlé klinické studie, při kterých je porovnáváno složení vybraných sloučenin v tumoru, okolní zdravé tkáni a tělních tekutinách získaných od nemocných a zdravých dobrovolníků. Hmotnostní spektrometrie patří mezi analytické techniky, které umožnují sledovat změny metabolismu na molekulární úrovni. Cílem naší práce bylo kvantitativně porovnat složení vybraných lipidů v chirurgicky vyoperovaných vzorcích tumoru a okolní zdravé tkáně a také složení ve vzorcích plasmy získaných od více než stovky dobrovolníků. Pro extrakci lipidů ze vzorků byla použita modifikovaná Folchova metoda. Organická složka byla následně analyzována pomocí hmotnostní spektrometrie s laserovou ionizací za účasti matrice a Orbitrap analyzátoru s vysokým hmotnostním rozlišením (MALDI-Orbitap-MS). Jako MALDI matrice byl použit 9-aminoakridin, který podpořil ionizaci kyselých lipidů při snímání záporně nabitých iontů. Z naměřených dat byly automaticky extrahovány intenzity předem identifikovaných deprotonovaných molekul lipidů. Pro každou studovanou třídu lipidů byly intenzity vztahovány k danému internímu standardu, který byl před extrakcí ke vzorkům přidáván.