Publication detail

Comparison of suction blistering and tape stripping for analysis of epidermal genes, proteins and lipids

Year: 2017

Type of publication: článek v odborném periodiku

Name of source: Archives of Dermatological Research

Page from-to: 757-765

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Srovnání sací bublinky a bandáže pro analýzu epidermálních genů, bílkovin a lipidů	Analýza epidermálních genů, proteinů a lipidů je důležitá při výzkumu a diagnostice kožních onemocnění. Ačkoli biopsie punch je metoda první volby pro vzorkování kůže, je zbytečně invazivní pro získání vzorku jen pro epidermální analýzu. Pro analýzu vybraných epidermálních genů (kvantitativní PCR reverzní transkripce v reálném čase, qRT-PCR), bílkoviny (Western blotting, WB) a srovnávací metody (SB) a strip stripping (TS) lipidů u deseti zdravých dobrovolníků. TS poskytovaly výrazně méně než SB a žádné životaschopné epidermální vrstvy nemohou být získány podle reflexní konfokální mikroskopie. Konzistentně byly TS detekovány pouze SC proteiny filaggrinu a housekeeping GAPDH společně s FLG a RPL13A mRNA. U vzorků SB by mohly WB a qRT-PCR snadno detekovat všechny vybrané proteiny (claudin-1, okluzin, filaggrin, laminin a GAPDH) a geny (CLDN1, OCLN, FLG, LAMA3 a RPL13A). Jeden vzorek SB dále poskytl dostatek materiálu pro imunohistochemické a lipidové analýzy, což nebylo možné u vzorků TS. Imunohistochemie vzorků SB ukázala intaktní epidermální strukturu a charakteristickou expresi claudinu-1. Infračervená spektroskopie ukázala dobře uspořádané lipidy s orthorhombickým a hexagonálním obalem a vysoce výkonná tenkovrstvá chromatografie potvrdila všechny třídy lipidů (včetně ceramidových podtřížek) ve správném poměru. Společně SB představuje spolehlivou metodu vzorkování, která může být použita pro víceúčelové epidermální analýzy v různých studiích.	sací bublinka; bandáž; epidermální; geny; proteiny; lipidy
eng	Comparison of suction blistering and tape stripping for analysis of epidermal genes, proteins and lipids	Analysis of epidermal genes, proteins and lipids is important in the research and diagnosis of skin diseases. Although punch biopsy is the first-choice technique for the skin sampling, it is unnecessarily invasive for obtaining a sample just for the epidermal analysis. Here we compare two less invasive methods, suction blistering (SB) and tape stripping (TS), for the analysis of selected epidermal genes (quantitative real-time reverse transcription PCR, qRT-PCR), proteins (western blotting, WB), and lipids in ten healthy volunteers. TS provided significantly less material than SB and no viable epidermal layers could be obtained according to the reflectance confocal microscopy. Consistently, only the SC protein filaggrin and housekeeping GAPDH together with FLG and RPL13A mRNA were detected by TS. In the SB samples, WB and qRT-PCR could easily detect all the selected proteins (claudin-1, occludin, filaggrin, laminin and GAPDH) and genes (CLDN1, OCLN, FLG, LAMA3 and RPL13A), respectively. A single SB sample further provided enough of material for immunohistochemistry and lipid analyses, which was not feasible with the TS samples. Immunohistochemistry of the SB samples showed intact epidermal structure and a characteristic expression of claudin-1. Infrared spectroscopy showed well-ordered lipids with both orthorhombic and hexagonal packing and high-performance thin layer chromatography confirmed all lipid classes (including ceramide subclasses) in correct proportions. Taken together, SB represents a reliable sampling technique that can be utilized for multipurpose epidermal analyses in various studies.	suction; blistering; tape; stripping; epidermal; genes; proteins; lipids

Search

Login for students

Login for employees

Publication detail

Departments

Other Parts

Map

Services

Popular Links