University of PardubiceFaculty of Chemical Technology

University

Employees
|
Students
Česky

Publication detail

Optimalizace polymerázové řetězové reakce pro detekci Caulobacter vibrioides

Authors: Petira Filip | Majtnerová Pavlína | Brožková Iveta | Roušar Tomáš

Year: 2020

Type of publication: ostatní - přednáška nebo poster

Page from-to: nestránkováno

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Optimalizace polymerázové řetězové reakce pro detekci Caulobacter vibrioides	Caulobacter vibrioides je Gram-negativní aerobní tyčinkovitá bakterie vyskytující se ve stojatých sladkých vodách. Hlavní živinou podporující růst bakterie Caulobacter vibrioides ve vodním prostředí je dostatečný obsah fosforu. Tato bakterie je modelovým organismem pro studium regulace buněčného cyklu, asymetrického dělení a buněčné diferenciace. Při buněčném dělení se bakterie dělí vždy asymetricky a produktem jsou dceřiné buňky lišící se jak svou strukturou, tak i funkcí. Metoda detekce bakterie Caulobacter vibrioides pomocí polymerázové řetězcové reakce (PCR) byla vytvořena pro screening potenciální kontaminace vzorků vody, laboratorních povrchů a růstových médií pro savčí buněčné kultury. Byly navrženy čtyři dvojice primerů se specifitou pro bakterii Caulobacter vibrioides, konkrétně pro její gen podJ, který poskytuje informace pro lokalizaci polárních organel. Testování probíhalo se vzorky obsahujícími DNA sbírkového kmene CCM3597 Caulobacter vibrioides a s dalšími vzorky (tj. DNA savčích buněk, směs DNA savčích buněk a bakterií Caulobacter vibrioides, DNA kvasinky Candida albicans SC 5314) pro potvrzení specifity vazby primerů na cílový gen bakterie Caulobacter vibrioides a pro odhalení potenciální kontaminace savčí kultury. Provedeno bylo také testování komerčně dodávaného PCR mixu a PCR mixu míchaného z jednotlivých komponent.	Polymerázová řetězová reakce; Caulobacter vibrioides