Login for students

Login for employees

Publication detail

Retention dependences support highly confident identification of lipid species in human plasma by reversed-phase UHPLC/MS
Authors: Vaňková Zuzana | Peterka Ondřej | Chocholoušková Michaela | Wolrab Denise | Jirásko Robert | Holčapek Michal
Year: 2022
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: Analytical and Bioanalytical Chemistry
Page from-to: 319-331
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Retenční závislosti podporují spolehlivou identifikaci lipidů v reverzní UHPLC/MS lidské plazmy Metoda reverzní ultra-vysokoúčinné kapalinové chromatografie spojené s hmotnostní spektrometrií (RP-UHPLC/MS) byla vyvinuta s cílem jednoznačně identifikovat velké množství lipidů z více lipidových tříd v lidské plazmě. Optimalizovaná metoda RP-UHPLC/MS použila kolonu C18 se sub-2-μm částicemi s celkovou dobou analýzy 25 min. Chromatografické rozlišení bylo zkoumáno se 42 standardy z 18 lipidových tříd. Systém UHPLC byl spojen s hybridním kvadrupólovým analyzátorem – analyzátorem doby letu (QTOF) s vysokým rozlišením, který využíval ionizaci elektrosprejem (ESI) a měřil hmotnostní spektrum úplného skenu a tandemová hmotnostní spektra (MS/MS) v pozitivních a negativních iontových režimech s vysokou hmotnostní přesností. Náš identifikační přístup byl založen na hodnotách m/z naměřených s hmotnostní přesností do 5 ppm tolerance v režimu úplného skenování, charakteristických fragmentových iontech v MS/MS a pravidelnosti v chromatografických závislostech na retenci jednotlivých lipidů, což poskytuje nejvyšší úroveň spolehlivosti pro referovanou identifikaci lipidů včetně regioizomerních a jiných izobarických forem. Grafy závislosti retenčních časů na počtu uhlíků nebo na počtu dvojných vazeb v mastných acylových řetězcích byly sestrojeny tak, aby podporovaly identifikaci lipidů v homologních lipidových řadách. Náš seznam identifikovaných lipidů je také porovnáván s předchozími publikacemi zkoumajícími vzorky lidské krve pomocí různých přístupů založených na MS. Celkem jsme nahlásili více než 500 lipidů reprezentujících 26 polárních a nepolárních lipidových tříd detekovaných ve standardním referenčním materiálu NIST 1950 lidské plazmy. lipidy; lipidomika; ultra-vysokoúčinná kapalinová chromatografie; reverzní fáze; hmotnostní spektrometrie; lidská plazma; retenční chování
eng Retention dependences support highly confident identification of lipid species in human plasma by reversed-phase UHPLC/MS Reversed-phase ultrahigh-performance liquid chromatography-mass spectrometry (RP-UHPLC/MS) method was developed with the aim to unambiguously identify a large number of lipid species from multiple lipid classes in human plasma. The optimized RP-UHPLC/MS method employed the C18 column with sub-2-μm particles with the total run time of 25 min. The chromatographic resolution was investigated with 42 standards from 18 lipid classes. The UHPLC system was coupled to high- resolution quadrupole-time-of-flight (QTOF) mass analyzer using electrospray ionization (ESI) measuring full-scan and tandem mass spectra (MS/MS) in positive- and negative-ion modes with high mass accuracy. Our identification approach was based on m/z values measured with mass accuracy within 5 ppm tolerance in the full-scan mode, characteristic fragment ions in MS/MS, and regularity in chromatographic retention dependences for individual lipid species, which provides the highest level of confidence for reported identifications of lipid species including regioisomeric and other isobaric forms. The graphs of depen- dences of retention times on the carbon number or on the number of double bond(s) in fatty acyl chains were constructed to support the identification of lipid species in homologous lipid series. Our list of identified lipid species is also compared with previous publications investigating human blood samples by various MS-based approaches. In total, we have reported more than 500 lipid species representing 26 polar and nonpolar lipid classes detected in NIST Standard reference material 1950 human plasma. lipids; lipidomics; ultrahigh-performance liquid chromatography; reversed-phase; mass spectrometry; human plasma; retention behavior

Departments

Other Parts

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0