University of Pardubice Faculty of Chemical Technology

University

Employees
|
Students
Česky

Publication detail

Recommendations for good practice in MS-based lipidomics

Authors: Köfeler Harald C. | Ahrends Robert | Baker Erin S. | Ekroos Kim | Han Xianlin | Hoffmann Nils | Holčapek Michal | Wenk Markus R. | Liebisch Gerhard

Year: 2021

Type of publication: článek v odborném periodiku

Name of source: Journal of Lipid Research

Page from-to: 100138

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Doporučení pro správnou praxi v lipidomice založené na MS	V posledních dvou desetiletích se lipidomika stala jednou z nejrychleji se rozšiřujících vědních disciplín v biomedicínském výzkumu. Vzhledem k rostoucímu počtu nových výzkumných skupin v této oblasti je ještě důležitější navrhnout pokyny pro zajištění vysoké kvality údajů. Pro tento účel se snaží lipidomická komunita v rámci Mezinárodní lipidomické společnosti vyvinout doporučení, která splňují nejlepší praktické nároky v lipidomice. Záměrem tohoto přezkumu je poukázat na kvalitativně nejrelevantnější aspekty pracovního lipidomického postupu, včetně preanalytických prací, přípravy vzorku, MS a identifikace a kvantifikace lipidů. Kromě toho tento přehled nejen upozorňuje na příklady osvědčených postupů, ale také osvětluje silné stránky, nevýhody a nástrahy v pracovním postupu lipidomické analýzy. I když tato recenze není sama o sobě koncipována jako postupný protokol, ani se nevěnuje konkrétní aplikaci lipidomiky, měla by přesto zainteresovanému čtenáři poskytnout odkazy a publikace, aby získal komplexní přehled o nejmodernějších postupech v dané oblasti.	lipidomika; metabolomika; MS; chromatografie; spektrometrie iontové mobility; fosfolipidy; sfingolipidy; LC-MS; identifikace lipidů
eng	Recommendations for good practice in MS-based lipidomics	In the last 2 decades, lipidomics has become one of the fastest expanding scientific disciplines in biomedical research. With an increasing number of new research groups to the field, it is even more important to design guidelines for assuring high standards of data quality. The Lipidomics Standards Initiative is a community-based endeavor for the coordination of development of these best practice guidelines in lipidomics and is embedded within the International Lipidomics Society. It is the intention of this review to highlight the most quality-relevant aspects of the lipidomics workflow, including pre- analytics, sample preparation, MS, and lipid species identification and quantitation. Furthermore, this review just does not only highlights examples of best practice but also sheds light on strengths, drawbacks, and pitfalls in the lipidomic analysis workflow. While this review is neither designed to be a step-by-step protocol by itself nor dedicated to a specific application of lipidomics, it should nevertheless provide the interested reader with links and original publications to obtain a comprehensive overview concerning the state-of-the-art practices in the field.	Lipidomics; Metabolomics; MS; Chromatography; Ion mobility spectrometry; Phospholipids; Sphingolipids; LC-MS; Lipid identification