Publication detail

Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data

Year: 2021

Type of publication: článek v odborném periodiku

Name of source: Nature Communications

Publisher name: Nature Publishing Group

Place: London

Page from-to: 4771

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Požadavky na kontrolu kvality pro správnou anotaci lipidomických údajů	Automatizovaná anotace lipidů založená na fragmentových iontových hmotnostních spektrech čelí třem hlavním výzvám; izobarické nebo izomerní lipidy z různých tříd často poskytují podobné fragmenty a nelze je jednoznačně porovnat; množství lipidových fragmentů silně závisí na experimentálních podmínkách, které kompromitují jejich podobnost s referenčními spektry; fragmentace spoluizolovaných prekurzorů z různých tříd často poskytuje vysoce spletitá spektra.	identifikace; lipidomické údaje
eng	Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data	Automated lipid species annotation based on fragment ion mass spectra faces three major challenges; isobaric or isomeric lipid species from different classes often yield similar fragments and cannot be unambigiously matched; the abundance of lipid fragments strongly depends on the experimental conditions which compromises their similarity to reference spectra; fragmentation of co-isolated precursors often originating from different classes yields highly convoluted spectra.	identification; lipidomics data

Search