Login for students

Login for employees

Publication detail

LipidQuant 1.0: automated data processing in lipid class separation–mass spectrometry quantitative workflows
Authors: Wolrab Denise | Cífková Eva | Čáň Pavel | Lísa Miroslav | Peterka Ondřej | Chocholoušková Michaela | Jirásko Robert | Holčapek Michal
Year: 2021
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: Bioinformatics
Page from-to: 4591-4592
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze LipidQuant 1.0: automatizované zpracování dat při oddělování lipidových tříd – kvantitativní pracovní postupy hmotnostní spektrometrie Představujeme LipidQuant 1.0 pro automatizované zpracování datových pracovních postupů v lipidomické kvantifikaci založené na oddělení lipidové třídy ve spojení s hmotnostní spektrometrií s vysokým rozlišením. Pracovní postupy separace lipidové třídy, jako je hydrofilní interakční kapalinová chromatografie nebo superkritická kapalinová chromatografie, by měly být preferovány v lipidomické kvantifikaci z důvodu koionizace vnitřních standardů lipidové třídy analyty ze stejné třídy. Jednotlivé kroky jsou v pracovním postupu LipidQuant vysvětleny, včetně identifikace lipidů, kvantifikace, izotopické korekce a vykazování výsledků. Ukazujeme aplikaci zpracování dat LipidQuant na malou kohortu vzorků lidského séra. LipidQuant; Lipidy; Hmotnostní spektrometrie; Kvantifikace; Lipidomika
eng LipidQuant 1.0: automated data processing in lipid class separation–mass spectrometry quantitative workflows We present the LipidQuant 1.0 tool for automated data processing workflows in lipidomic quantitation based on lipid class separation coupled with high-resolution mass spectrometry. Lipid class separation workflows, such as hydrophilic interaction liquid chromatography or supercritical fluid chromatography, should be preferred in lipidomic quantitation due to the coionization of lipid class internal standards with analytes from the same class. The individual steps in the LipidQuant workflow are explained, including lipid identification, quantitation, isotopic correc- tion and reporting results. We show the application of LipidQuant data processing to a small cohort of human serum samples. LipidQuant; Lipids; Mass spectrometry; Quantification; Lipidomics

Departments

Other Parts

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives