Publication detail

Introduction of a lipidomics scoring system for data quality assessment

Year: 2025

Type of publication: článek v odborném periodiku

Name of source: Journal of Lipid Research

Publisher name: American Society for Biochemistry and Molecular Biology

Place: Rockville

Page from-to: 100817

Titles:

Language	Name	Abstract	Keywords
cze	Zavedení lipidomického skórovacího systému pro hodnocení kvality dat	Vědní obor lipidomiky vykazuje v posledních letech neustále rostoucí počet publikací, což je spojeno se zvýšenou potřebou zavedení standardů kvality. Zatímco oficiální zkratková nomenklatura lipidů představuje první a důležitý krok směrem k nástroji pro zajištění kvality reportování, další bodové hodnocení by umožnilo posoudit kvalitu uváděných dat s ještě vyšší mírou podrobnosti. Proto navrhujeme skórovací schéma pro lipidomiku, které zohledňuje všechny různé vrstvy analytických informací získaných pomocí hmotnostní spektrometrie, chromatografie a iontově-migrační spektrometrie a uděluje body za každou z nich. Navíc je toto skórovací schéma integrováno s úrovněmi anotace, jak je navrhuje oficiální zkratková nomenklatura, přičemž bodové skóre přibližně odpovídá úrovni podrobností dané anotované sloučeniny. Výhodou takového systému je skutečnost, že převádí důkazy pro strukturální informace do číselného vyjádření, které poskytuje i neodborníkovi v oblasti lipidomiky rychlou představu o kvalitě reportovaných dat. Dodatečně může sloužit jako pomůcka pro interní kontrolu kvality a pro hodnocení kvality dat v rámci recenzního řízení.	chromatografie; glycerofosfolipidy; lipidomika; lipidy; hmotnostní spektrometrie; sfingolipidy; steroly
eng	Introduction of a lipidomics scoring system for data quality assessment	The scientific field of lipidomics has shown a constantly growing publication number in recent years, which is accompanied by an increasing need for quality standards. While the official shorthand nomenclature of lipids is a first and important step toward a reporting quality tool, an additional point score would reflect the quality of reported data at an even more detailed granularity. Thus, we propose a lipidomics scoring scheme that considers all the different layers of analytical information to be obtained by mass spectrometry, chromatography, and ion mobility spectrometry and awards scoring points for each of them. Furthermore, the scoring scheme is integrated with the annotation levels as proposed by the official shorthand nomenclature, with a point score, which roughly correlates with the annotated compound details. The merit of such a scoring system is the fact that it abstracts evidence for structural information into a number, which gives even the nonlipidomics expert an idea about the reporting, and by extension, data quality at first glance. Additionally, it could serve as an aid for internal quality control and for data quality assessment in the peer review process.	chromatography glycerophospholipids; lipidomics; lipids; mass spectrometry sphingolipids; sterols

Search

Login for students

Login for employees

Publication detail

Departments

Other Parts

Map

Services

Popular Links