Login for students

Login for employees

Publication detail

Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate
Authors: Smělá Denisa | Zelinková Eliška | Řehulka Pavel | Bílková Zuzana | Kupčík Rudolf
Year: 2022
Type of publication: článek v odborném periodiku
Name of source: International Journal of Molecular Sciences
Publisher name: MDPI
Place: BASEL
Page from-to: 8848
Titles:
Language Name Abstract Keywords
cze Extrakce miRNA z buněčného lyzátu bez fenol/chloroformu s využitím nosiče na bázi TiO2 Ačkoliv jsou microRNA považovány za excelentní biomarkery pro řadu onemocnění, jejich izolace má stále řadu limitací. V této studii jsme se zaměřili na vývoj nové metody izolace RNA, která by některé z těchto limitů pomohla překonat. V této práce je uvedena nová, ekonomicky dostupná metoda izolace RNA, která nevyužívá systému fenol/chloroform. RNA je extrahována z buněčného lyzátu pomocí systému isopropanol/voda/NaCl, který je následován extrakcí na pevnou fázi s využitím TiO2 mikrosfér. Je zde také popsán vliv pH na selektivitu TiO2 mikrosfér k různým velikostem RNA molekul. Pomocí úpravy vazebných podmínek je možné regulovat, jaké rozmezí velikostí RNA molekul bude během extrakce na pevnou fázi ze vzorku izolováno. miRNA izolace; TiO2; extrakce krátkých RNA
eng Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate While microRNAs are considered as excellent biomarkers of various diseases, there are still several remaining challenges regarding their isolation. In this study, we aimed to design a novel RNA isolation method that would help to overcome those challenges. Therefore, we present a novel phenol/chloroform-free, low-cost method for miRNA extraction. Within this method, RNA is extracted from cell lysate with an isopropanol/water/NaCl system, followed by solid-phase extraction using TiO2 microspheres to effectively separate short RNAs from long RNA molecules. We also demonstrated the pH-dependent selectivity of TiO2 microspheres towards different sizes of RNA. We were able to regulate the size range of extracted RNAs with simple adjustments in binding conditions used during the solid-phase extraction. miRNA isolation; TiO2; phenol/chloroform-free; short RNA extraction

Departments

Other Parts

Map

en.mapy.cz

Services

Popular Links

© 2023 University of Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Phone: +420 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Webmaster, RSS
Data box ID: f5vj9hu
Accessibility Statement
CC BY-NC-ND 4.0Creative CommonsAttributionNonCommercialNoDerivatives