Charakterizace lidského lipidomu a metabolomu pro personalizovanou zdravotní péči a hledání biomarkerů: studie rakoviny ledvin
Poskytovatel: Grantová agentura ČR
Program: Standardní projekty
Období realizace: 01.01.18 - 31.12.20
Pracoviště:
Fakulta chemicko-technologická - Katedra analytické chemie
Hlavní řešitel: Holčapek MichalSpoluřešitelé: Jirásko Robert
Popis:
Hlavní cíl projektu je vývoj celkové metodologie pro komplexní kvantitativní charakterizaci lipidomu a metabolomu ve vzorcích lidské plazmy a moči zdravých dobrovolníků s ohledem na skupiny podle věku a pohlaví. Všechny analytické metody budou validovány pro vysoce výkonnou kvantifikaci lipidů a metabolitů. Tento komplexní přístup pokrývá všechny kroky zahrnující výběr osob, odběr vzorků, zpracování vzorků, analýzu a kvantifikaci založenou na hmotnostní spektrometrii, zpracování dat, statistické vyhodnocení a biologickou interpretaci. Vypracovaná metodologie bude použita pro případovou studii pacientů s buněčným renálním karcinomem (RCC) s cílem identifikovat nejvíce dysregulované lipidy a metabolity s použitím pokročilých metod vícerozměrné analýzy dat a biologické vysvětlení pozorovaných změn pro obě skupiny společně. Mimobuněčné vezikuly budou testovány jako perspektivní zdroj biomarkerů pro diagnostiku rakoviny. Bude vytvořena databáze s více než 1000 lipidů a metabolitů pro použití ve studiích zaměřených na zdravotní péči a hledání biomarkerů.
Hlavní cíl projektu je vývoj celkové metodologie pro komplexní kvantitativní charakterizaci lipidomu a metabolomu ve vzorcích lidské plazmy a moči zdravých dobrovolníků s ohledem na skupiny podle věku a pohlaví. Všechny analytické metody budou validovány pro vysoce výkonnou kvantifikaci lipidů a metabolitů. Tento komplexní přístup pokrývá všechny kroky zahrnující výběr osob, odběr vzorků, zpracování vzorků, analýzu a kvantifikaci založenou na hmotnostní spektrometrii, zpracování dat, statistické vyhodnocení a biologickou interpretaci. Vypracovaná metodologie bude použita pro případovou studii pacientů s buněčným renálním karcinomem (RCC) s cílem identifikovat nejvíce dysregulované lipidy a metabolity s použitím pokročilých metod vícerozměrné analýzy dat a biologické vysvětlení pozorovaných změn pro obě skupiny společně. Mimobuněčné vezikuly budou testovány jako perspektivní zdroj biomarkerů pro diagnostiku rakoviny. Bude vytvořena databáze s více než 1000 lipidů a metabolitů pro použití ve studiích zaměřených na zdravotní péči a hledání biomarkerů.
