Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Detection of Single Nucleotide Polymorphisms in p53 Mutation Hotspots and Expression of Mutant p53 in Human Cell Lines Using an Enzyme-Linked Electrochemical Assay
Autoři: Horáková Petra | Šimková Eva | Vychodilová Zdenka | Brázdová Marie | Fojta Miroslav
Rok: 2009
Druh publikace: článek v odborném periodiku
Název zdroje: Electroanalysis
Název nakladatele: Wiley-VCH
Místo vydání: Weinheim
Strana od-do: 1723-1729
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze V publikaci je představena enzymová elektrochemická metoda pro detekci jednonukleotidových polymorfismů (SNP) v nádorovém supresorovém genu p53. Tato metoda je založena na prodloužení primeru katalyzovaném DNA polymerázou o jeden nukleotid nesoucí biotin, navázání konjugátu streptavidinu s alkalickou fosfatázou a následné elektrochemické detekci produktu enzymové reakce. Kromě modelových studií se syntetickými oligonukleotidy byla provedena detekce exprese mutantního p53 v lidských buněčných liniích.
eng Detection of Single Nucleotide Polymorphisms in p53 Mutation Hotspots and Expression of Mutant p53 in Human Cell Lines Using an Enzyme-Linked Electrochemical Assay An enzyme-linked electrochemical technique for single nucleotide polymorphism (SNP) typing in the p53 tumor suppressor gene is presented. The technique is based on a DNA polymerase-catalyzed extension of a primer hybridized to a target DNA strand upstream to the SNP site by one nucleotide bearing a biotin tag. Efficient incorporation of the biotinylated nucleotide occurs only in the case of complementarity between the first nucleotide in ss 5-overhang of the target strand. The biotin tag is detected after capture of the primer extension products at magnetic beads bearing oligoT strands via oligoA adaptors at 5-ends of the primer, binding of streptavidin-alkaline conjugate and enzymatic conversion of 1-naphthyl phosphate into 1-naphthol. In addition to model studies with synthetic oligonucleotides, we report on detection of mutant p53 expression in human cell lines using reverse transcription-PCR technique combined with amplified primer extension and the magnetic beads-based electrochemical assay. enzyme-linked electrochemical assay;SNP typing;p53;mutation;magnetic beads;polymorphism