Publikace detail

Identification of carbonic anhydrase I immunodominant epitopes recognized by specific autoantibodies which indicate an improved prognosis in patients with malignancy after autologous stem cell transplantation

Rok: 2010

Druh publikace: článek v odborném periodiku

Název zdroje: Journal of Proteome Research

Název nakladatele: American Chemical Society

Místo vydání: Washington

Strana od-do: 5171-5179

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Identifikace imunodominantních epitopů karbonické anhydrázy I pomocí specifických autoprotilátek indikujících zlepšení prognózy u pacientů s malignitou po autologní transplantaci kmenových buněk	Tato práce se zabývá epitopovým mapováním karbonické anhydrázy (CA), izoformy I (CA I), pro detekci hlavních imunodominantních epitopů. Náš zájem vznikl na základě pozorování spontánní regrese tumoru u pacientů, kteří po vysokodávkové terapii s autologní transplantací kmenových buněk vykazovali syndrom aplastické anémie a jejichž séra obsahovala vysoký titr autoprotilátek proti karbonické anhydráze (anti-CA). CA I byla vybrána jako vysoce abundantní a široce rozšířená izoforma. Použitý analytický přístup se skládá ze specifické fragmentace proteinu CA I a následné imunospecifické izolace peptidů reagujících s polyklonálními anti-CA I autoprotilátkami pacienta. Vylepšili jsme standardní schéma epitopového mapování použitím magnetických nosičů a biomagnetických separačních technik. Pro detekci a identifikaci epitopů byla použita hmotnostní spektrometrie a získané výsledky byly ověřeny bioinformaticky. V článku jsou diskutovány kandidátní epitopy CA I jako potenciální terapeutické působky.	epitopové mapování; karbonická anhydráza I; anti-CA autoprotilátky; LC-MS/MS; bioinformatika; autologní transplantace kmenových buněk; spontánní remise
eng	Identification of carbonic anhydrase I immunodominant epitopes recognized by specific autoantibodies which indicate an improved prognosis in patients with malignancy after autologous stem cell transplantation	This work employs an epitope mapping of carbonic anhydrase (CA), isoform I (CA I), for detection of the main immunodominant epitopes. Our interest has arisen from an observed spontaneous tumor regression in patients who developed an aplastic anemia type syndrome after a high-dose therapy with autologous stem cell transplantation and whose sera contained high titer of anti carbonic anhydrase (anti-CA) autoantibodies. CA I has been selected for our study as a highly abundant and widely distributed isoform. The applied analytical approach consists of specific fragmentation of CA I protein followed by immunospecific isolation of peptides reacting with polyclonal anti-CA I autoantibodies of patients in spontaneous remission. We improved the standard epitope mapping schema by incorporating the benefits of magnetic carriers and biomagnetic separation techniques. Mass spectrometry has been applied for detection and identification of epitopes and the acquired results were verified by bioinformatic tools.	epitope mapping; carbonic anhydrase I; anti-CA autoantibodies; LC-MS/MS; bioinformatic tools; autologous stem cell transplantation; spontaneous remission

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Katedry

Ústavy a pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte