Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Utilization of Electrochemical Activity of 7-Deazaguanine in the Monitoring of PCR Amplification of G-rich DNA Strands
Autoři: Fojtová Miloslava | Horáková Petra | Pivoňková Hana | Vychodilová Zdenka | Fojta Miroslav
Rok: 2010
Druh publikace: článek ve sborníku
Název zdroje: Sborník přednášek mezinárodní odborné konference XXX. Moderní elektrochemické metody
Název nakladatele: BEST Servis
Místo vydání: Ústí nad Labem
Strana od-do: 50-54
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Využití elektrochemické aktivity 7-deazaguaninu při monitorování PCR amplifikace G-bohatých řetězců DNA 7-deazaguanin je analog guaninu, který lze sekvenčně specificky inkorporovat do DNA. Inkorporace 7-deazaguaninu do PCR amplikonů byla sledována pomocí voltametrické analýzy una hlíkových elektrodách. 7-Deazaguanin; elektrochemická analýza; značení DNA; PCR; PCR v reálném čase
eng Utilization of Electrochemical Activity of 7-Deazaguanine in the Monitoring of PCR Amplification of G-rich DNA Strands 7-Deazaguanine (G*) is an analogue of guanine incorporable sequence-specifically into DNA but incapable of forming Hoogsteen base pairs. Reduced tendency of G* to form alternative DNA structures is utilized in PCR amplification of guanine-rich nucleotide sequences. G* is electrochemically active, being oxidized at significantly lower potentials, compared to guanine and all other nucleobases. We show that incorporation of G* into PCR amplicons can easily be monitored by voltammetric analysis of the modified DNA at carbon electrodes. Densely G*-modified DNA fragments exhibit quenching of fluorescence of SYBR Green I dye, commonly used for gel staining and real time PCR applications, the electrochemical detection provides G*-specific signal suitable for the quantification of the amplified DNA as well as for the determination of the DNA modification extent. 7-Deazaguanine; Electrochemical analysis; DNA labeling; PCR; Real-time PCR