Publikace detail

Comparison of Methods for Isolating Fungal DNA

Autoři: Moťková Petra | Vytřasová Jarmila

Rok: 2011

Druh publikace: článek v odborném periodiku

Název zdroje: Czech journal of food sciences

Název nakladatele: Česká akademie zemědělských věd

Místo vydání: Praha

Strana od-do: 76-85

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Porovnání různých metody izolace plísňové DNA	V této studii byly optimalizovány a porovnávány metody izolace a imobilizace DNA. Cílem izolačních postupů bylo získat DNA o dostatečné kvalitě a kvantitě potřebné pro její amplifikaci, neboť většina technik vyžaduje amplifikaci DNA před její vlastní detekcí. Za tímto účelem byly porovnávány a optimalizovány klasické postupy extrakce DNA s izolacemi pomocí komerčních souprav. Metody byly hodnoceny z několika hledisek, důraz byl kladen hlavně na to, aby vyizolovaná DNA neobsahovala PCR inhibitory, které by bránily amplifikaci DNA, a tudíž by znemožňovaly vlastní detekci. Pro optimalizaci jednotlivých metod byly použity sbírkové kmeny rodu Aspergillus. Po vyhodnocení byly vybrány dvě nejvhodnější metody pro zpracování vzorků pozitivních na přítomnost potenciálně aflatoxinogenních plísní. Jednalo se o použití kitu pro izolaci DNA z listů rostlin od firmy Sigma a metodu dle Cenise s rozrušením mycelia pomocí kapalného dusíku.	DNA plísní;DNA izolace;PCR;Aspergillus
eng	Comparison of Methods for Isolating Fungal DNA	The aim of the isolation processes was to obtain DNA of sufficient quality and quantity necessary for its amplification, as most detection techniques require DNA amplification before the proper DNA detection itself. For this purpose, classic methods of DNA extraction were compared and optimised while isolations using commercial kits were also done. The methods were evaluated from several perspectives, with focus especially laid on the isolated DNA not contain PCR inhibitors which would prevent DNA amplification, thus inhibiting the detection itself. For optimising the individual methods, collection strains of the genus Aspergillus were used. After the evaluation, two most suitable methods were selected and chosen for isolating potentially aflatoxigenic moulds taken from food samples. These methods were the commercially supplied kit for isolating DNA from plant leaves from Sigma and a classic method according Cenis in combination with the cell wall disruption by means of liquid nitrogen.	fungal DNA;DNA isolation;PCR;Aspergillus

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Katedry

Ústavy a pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte