Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Metody použité pro analýzu fosfoproteinů bakterie Francisella tularensis
Autoři: Jankovičová Barbora | Řehulka Pavel | Kupčík Rudolf | Tichý Aleš | Řehulková Helena | Kroupa Tomáš | Mann Benjamin | Špidlová Petra | Klimentová Jana | Hernychová Lenka | Horák Daniel | Stulík Jiří | Novotný Miloš | Bílková Zuzana
Rok: 2012
Druh publikace: článek ve sborníku
Název zdroje: XXI. Konference mladých mikrobiologů: Tomáškovy dny 2012
Název nakladatele: Masarykova univerzita
Místo vydání: Brno
Strana od-do: 87-88
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Metody použité pro analýzu fosfoproteinů bakterie Francisella tularensis Posttranslační modifikace (PTM) proteinů hrají důležitou roli v regulaci různých biologických procesů. Jednou z nejdůležitějších, nejrozšířenějších a nejlépe popsaných PTM je fosforylace. Cílem této práce bylo prokázat existenci fosforylovaných forem proteinů v proteomu intracelulárního bakteriálního patogena Francisella tularensis (FT) a provést jejich detailní charakterizaci s cílem určit místo fosforylace. K obohacení fosfoproteinů/peptidů byly použity separační postupy využívající magnetické mikro- a nanočástice s povrchem modifikovaným ionty kovů, kovovými oxidy nebo specifickými protilátkami. Pro určení molekulárních charakteristik identifikovaných fosfoproteinů/peptidů byly použity hmotnostně-spektrometrické metody s využitím bioinformatických nástrojů. fosfoproteiny; Francisella tularensis; posttranslační modifikace; hmotnostní spektrometrie; afinitní chromatografie
eng Methods used for the analysis of bacteria Francisella tularensis phosphoproteins Posttranslational modifications (PTM) play an important role in regulation of different biological processes. Protein phosphorylation is one of the most widespread and crucial PTM. The aim of this work was to prove presence of phosphorylated proteins in proteome of intracellular bacterial pathogen Francisella tularensis (FT) and carry out their detailed characterization in order to determine the phosphorylation sites. We applied separation procedures using magnetic micro- and nanoparticles with modified surfaces either by metal ions, oxides or by specific antibodies for enrichment of these proteins. Mass spectrometry combined with bioinformatics tools was utilized for identification of phosphoproteins/peptides. phosphoproteins; Francisella tularensis; posttranslational modifications; mass spectrometry; affinity chromatography