Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Lipidomic analysis of biological samples: Comparison of liquid chromatography, supercritical fluid chromatography and direct infusion mass spectrometry methods
Autoři: Lísa Miroslav | Cífková Eva | Khalikova Maria | Ovčačíková Magdaléna | Holčapek Michal
Rok: 2017
Druh publikace: článek v odborném periodiku
Název zdroje: Journal of Chromatography A
Strana od-do: 96-108
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Porovnání metod kapalinové chromatografie, superkritické fluidní chromatografie a hmotnostní spektrometrie s přímou infuzí Lipidomická analýza biologických vzorků v klinickém výzkumu představuje náročný úkol pro analytické metody. Je to dáno velkým počtem vzorků a jejich složitostí. V této práci porovnáváme přímou infuzi (DI) a chromatografii - hmotnostní spektrometrií (MS). Analytické metody jsou srovnávány z hlediska komplexnosti a výsledků validace lipidomické analýzy biologických vzorků, kterými byly nádorové tkáně, normální tkáně, plazma a erytrocyty pacientů s rakovinou ledvin. Metody jsou porovnávány v jedné laboratoři za použití stejného analytického protokolu, tak aby byly zajištěny srovnatelné podmínky. Metoda ultra-účinné kapalinové chromatografie / MS (UHPLC / MS) v režimu hydrofilní interakční chromatografie a metoda DI-MS se používají pro toto srovnání jako nejpoužívanější metody pro lipidomickou analýzu spolu s ultra-účinnou superkritickou fluidní chromatografií / MS UHPSFC / MS), která vykazuje slibné výsledky v metabolomických analýzách. Necílená analýza vzorků se provádí za použití všech uvedených metod a je identifikováno 610 lipidů v rámci 23 tříd. Metoda DI poskytuje nejkomplexnější výsledky díky identifikaci některých tříd polárních lipidů, které nejsou identifikovány metodami UHPLC a UHPSFC. Na druhou stranu metoda UHPSFC poskytuje vynikající citlivost pro méně polární třídy lipidů a nejvyšší průchodnost vzorku v průběhu doby 10 minut. Spotřeba vzorku metodou DI je 125krát vyšší než u jiných metod, zatímco pro analýzu jednoho vzorku je použito pouze 40μl organického rozpouštědla ve srovnání s 3,5mL a 4,9mL u metod UHPLC a UHPSFC. Metody jsou validovány pro kvantitativní lipidomickou analýzu vzorků plazmy s jedním vnitřním standardem pro každou třídu lipidů. Výsledky ukazují použitelnost všech testovaných metod pro lipidomickou analýzu biologických vzorků v závislosti na požadavcích analýzy. Kapalinová chromatografie; Superkritická kapalinová chromatografie; Přímá infúze; Hmotnostní spektrometrie; Lipidomická analýza
eng Lipidomic analysis of biological samples: Comparison of liquid chromatography, supercritical fluid chromatography and direct infusion mass spectrometry methods Lipidomic analysis of biological samples in a clinical research represents challenging task for analytical methods given by the large number of samples and their extreme complexity. In this work, we compare direct infusion (DI) and chromatography - mass spectrometry (MS) lipidomic approaches represented by three analytical methods in terms of comprehensiveness, sample throughput, and validation results for the lipidomic analysis of biological samples represented by tumor tissue, surrounding normal tissue, plasma, and erythrocytes of kidney cancer patients. Methods are compared in one laboratory using the identical analytical protocol to ensure comparable conditions. Ultrahigh-performance liquid chromatography/MS (UHPLC/MS) method in hydrophilic interaction liquid chromatography mode and DI-MS method are used for this comparison as the most widely used methods for the lipidomic analysis together with ultrahigh-performance supercritical fluid chromatography/MS (UHPSFC/MS) method showing promising results in metabolomics analyses. The nontargeted analysis of pooled samples is performed using all tested methods and 610 lipid species within 23 lipid classes are identified. DI method provides the most comprehensive results due to identification of some polar lipid classes, which are not identified by UHPLC and UHPSFC methods. On the other hand, UHPSFC method provides an excellent sensitivity for less polar lipid classes and the highest sample throughput within 10min method time. The sample consumption of DI method is 125 times higher than for other methods, while only 40μL of organic solvent is used for one sample analysis compared to 3.5mL and 4.9mL in case of UHPLC and UHPSFC methods, respectively. Methods are validated for the quantitative lipidomic analysis of plasma samples with one internal standard for each lipid class. Results show applicability of all tested methods for the lipidomic analysis of biological samples depending on the analysis requirements. Liquid chromatography; Supercritical fluid chromatography; Direct infusion; Mass spectrometry

Katedry

Ústavy a pracoviště

Jak nás najdete?

zobrazit na mapy.cz

Služby

Často hledáte

© 2023 Univerzita Pardubice, Studentská 95, 532 10 Pardubice 2
Telefon: 466 036 111, 466 036 112, 466 036 113
Správce webu, RSS
ID datové schránky: f5vj9hu
Prohlášení o přístupnosti
CC BY-NC-ND 4.0 CZ