Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Amorphous TiO2 Nanotubes as a Platform for Highly Selective Phosphopeptide Enrichment
Autoři: Kupčík Rudolf | Macák Jan | Řehulková Helena | Sopha Hanna Ingrid | Fabrik Ivo | Veettikkunnu Chandran Anitha | Klimentová Jana | Murasová Pavla | Bílková Zuzana | Řehulka Pavel
Rok: 2019
Druh publikace: článek v odborném periodiku
Název zdroje: ACS Omega
Název nakladatele: American Chemical Society
Místo vydání: Washington
Strana od-do: 12156-12166
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Amorfní nanotrubičky TiO2 jako platforma pro vysoce selektivní obohacení fosfopeptidů V práci je představeno vysoce selektivní obohacení fosfopeptidů pomocí amorfních TiO2 nanotrubic (TiO2NTs) stejně jako pomocí stejného materiálu pokrytého superparamagnetickými nanočásticemi Fe3O4 (TiO2NTs@Fe3O4NPs). Oba materiály, TiO2NTs a TiO2NTs@Fe3O4NPs, byly použity pro obohacení fosfopeptidů z jednoduché peptidové směsi (trypticky štěpený hovězí sérový albumin a alfa-kasein) a ze směsi komplexních peptidů (trypticky štěpený lyzát Jurkat T buněk). Získaná účinnost obohacení a selektivita pro fosfopeptidy u materiálů TiO2NT a TiO2NTs@Fe3O4NPs byla zvýšena o 28,7 a 25,3%, ve srovnání se zavedenými mikrokuličkami TiO2. Protokol pro obohacování byl rozšířen o druhý eluční krok usnadňující identifikaci dalších fosfopeptidů. Dále se ukázalo, že oba typy amorfních TiO2 nanotrubic poskytují kvalitativně nové fyzikálně-chemické vlastnosti, které jsou jasně výhodné pro vysoce selektivní obohacení fosfopeptidů. To bylo také experimentálně potvrzeno, což vedlo k podstatnému snížení nefosforylovaných peptidů v obohacených vzorcích. Kromě toho, TiO2NTs@Fe3O4NPs kombinují vysokou selektivitu a snadnou manipulaci díky superparamagnetickému charakteru materiálu. Prezentované materiály a jejich užitná hodnota jsou slibné pro aplikace u celé řady dalších typů biomolekul, které mají být zpracovány podobným způsobem. afinitní chromatografie; titanové nanotrubice; fosforylace; separace; purifikace; mikrosféry; adsorpce; oxid titaničitý; vrstvy; identifikace
eng Amorphous TiO2 Nanotubes as a Platform for Highly Selective Phosphopeptide Enrichment This work reports highly selective phosphopeptide enrichment using amorphous TiO2 nanotubes (TiO2NTs) and the same material decorated with superparamagnetic Fe3O4 nanoparticles (TiO2NTs@Fe(3)O(4)NPs). TiO2NTs and TiO2NTs@Fe(3)O(4)NPs materials were applied for phosphopeptide enrichment both from a simple peptide mixture (tryptic digest of bovine serum albumin and alpha-casein) and from a complex peptide mixture (tryptic digest of Jurkat T cell lysate). The obtained enrichment efficiency and selectivity for phosphopeptides of TiO2NTs and TiO2NTs@ Fe(3)O(4)NPs were increased to 28.7 and 25.3%, respectively, as compared to those of the well-established TiO2 microspheres. The enrichment protocol was extended for a second elution step facilitating the identification of additional phosphopeptides. It further turned out that both types of amorphous TiO2 nanotubes provide qualitatively new physicochemical features that are clearly advantageous for highly selective phosphopeptide enrichment. This has been confirmed experimentally resulting in substantial reduction of non-phosphorylated peptides in the enriched samples. In addition, TiO2NTs@Fe(3)O(4)NPs combine high selectivity and ease of handling due to the superparamagnetic character of the material. The presented materials and performances are further promising for applications toward a whole range of other types of biomolecules to be treated in a similar fashion. affinity-chromatography; titania nanotubes; phosphorylation; separation; purification; microspheres; adsorption; titanium dioxide; layers; identification