Publikace detail

Lipidomic characterization of exosomes isolated from human plasma using various mass spectrometry techniques

Rok: 2020

Druh publikace: článek v odborném periodiku

Název zdroje: Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids

Název nakladatele: Elsevier Science BV

Místo vydání: Amsterdam

Strana od-do: 158634

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Lipidomická charakterizace exosomů izolovaných z lidské plazmy pomocí různých technik hmotnostní spektrometrie	Ultravysokoúčinná superkritická kapalinová chromatografie - hmotnostní spektrometrie (UHPSFC / MS), ultravysokoúčinná kapalinová chromatografie - hmotnostní spektrometrie (UHPLC / MS) a laserová desorpce / ionizace (MALDI) - MS byly použity pro lipidomickou charakterizaci exosomů izolovaných z lidské plazmy. Vysokoúčinné metody UHPSFC / MS a UHPLC / MS využívající kolonu na bázi oxidu křemičitého obsahující částice sub-2 um umožnily separaci lipidové třídy a kvantifikaci na základě interních standardů exogenní třídy v době běhu <7 minut. MALDI poskytl doplňující informace o třídách aniontových lipidů, jako jsou sulfatidy. Byla provedena necílená analýza 12 zdravých dobrovolníků a byla kvantifikována absolutní molární koncentrace 244 lipidů v exosomech a 191 lipidů v plazmě patřících do 10 lipidových tříd. Statistické vyhodnocení dat zahrnovalo analýzu hlavních složek, ortogonální částečnou diskriminační analýzu nejmenších čtverců, S-grafy, p-hodnoty, T-hodnoty, násobné změny, míru falešných objevů, krabicové grafy a korelační grafy, které vyústily v informace o lipidech změny v exosomech ve srovnání s plazmou. Hlavní změny byly detekovány ve složení triacylglycerolů, diacylglycerolů, fosfatidylcholinů a lysofosfatidylcholinů, přičemž sfingomyeliny, fosfatidylinositoly a sulfatidy vykazovaly v obou biologických matricích poměrně podobné profily	Lipidomika; Lipidy; Exosomy; Plasma; Hmotnosní spektrometrie; Superkritická fluidní chromatografie; Kapalinová chromatografie
eng	Lipidomic characterization of exosomes isolated from human plasma using various mass spectrometry techniques	Ultrahigh-performance supercritical fluid chromatography - mass spectrometry (UHPSFC/MS), ultrahigh-performance liquid chromatography - mass spectrometry (UHPLC/MS), and matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) - MS techniques were used for the lipidomic characterization of exosomes isolated from human plasma. The high-throughput methods UHPSFC/MS and UHPLC/MS using a silica-based column containing sub-2 mu m particles enabled the lipid class separation and the quantitation based on exogenous class internal standards in < 7 minute run time. MALDI provided the complementary information on anionic lipid classes, such as sulfatides. The nontargeted analysis of 12 healthy volunteers was performed, and absolute molar concentration of 244 lipids in exosomes and 191 lipids in plasma belonging to 10 lipid classes were quantified. The statistical evaluation of data included principal component analysis, orthogonal partial least square discriminant analysis, S-plots, p-values, T-values, fold changes, false discovery rate, box plots, and correlation plots, which resulted in the information on lipid changes in exosomes in comparison to plasma. The major changes were detected in the composition of triacylglycerols, diacylglycerols, phosphatidylcholines, and lysophosphatidylcholines, whereby sphingomyelins, phosphatidylinositols, and sulfatides showed rather similar profiles in both biological matrices.	Lipidomics; Lipids; Exosomes; Plasma; Mass spectrometry; Supercritical fluid chromatography; Liquid chromatography

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Katedry

Ústavy a pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte