Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Lipidomic and metabolomic analysis reveals changes in biochemical pathways for non-small cell lung cancer tissues
Autoři: Cífková Eva | Brumarová Radana | Ovčačíková Magdaléna | Dobešová Dana | Mičová Kateřina | Kvasnička Aleš | Vaňková Zuzana | Šiller Jiří | Sákra Lukáš | Friedecký David | Holčapek Michal
Rok: 2022
Druh publikace: článek v odborném periodiku
Název zdroje: Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids
Strana od-do: 159082
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Lipidomická a metabolomická analýza odhaluje změny v biochemických drahách nemalobuněčných plicních nádorových tkání Rakovina plic představuje jednu z předních celosvětových příčin úmrtí na rakovinu, ale patobiochemie tohoto onemocnění stále není plně pochopena. Zde charakterizujeme lipidomické a metabolomické profily nádoru a okolních normálních tkání pro 23 pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic. Celkem bylo identifikováno a kvantifikováno 500 molekulárních druhů kombinací shotgun lipidomické tandemové hmotnostní spektrometrie (MS/MS) a cíleného metabolomického přístupu s využitím kapalinové chromatografie (LC) – MS/MS. Statistické hodnocení zahrnuje vícerozměrné a jednorozměrné metody s důrazem na párové statistické přístupy. Náš výzkum odhalil významné změny v několika biochemických drahách souvisejících s centrálním metabolismem uhlíku, acylkarnity, dipeptidy, stejně jako narušení metabolismu lipidů pozorované hlavně u glykofosfolipidů, sfingolipidů a cholesterylesterů. rakovina plic; lipidomika; metabolomika; hmotnostní spektrometrie; metabolismus
eng Lipidomic and metabolomic analysis reveals changes in biochemical pathways for non-small cell lung cancer tissues Lung cancer represents one of the leading worldwide causes of cancer death, but the pathobiochemistry of this disease is still not fully understood. Here we characterize the lipidomic and metabolomic profiles of the tumor and surrounding normal tissues for 23 patients with non-small cell lung cancer. In total, 500 molecular species were identified and quantified by a combination of the lipidomic shotgun tandem mass spectrometry (MS/MS) analysis and the targeted metabolomic approach using liquid chromatography (LC) – MS/MS. The statistical evaluation includes multivariate and univariate methods with the emphasis on paired statistical approaches. Our research revealed significant changes in several biochemical pathways related to the central carbon metabolism, acylcarnitines, dipeptides as well as the disruption in the lipid metabolism observed mainly for glycer- ophospholipids, sphingolipids, and cholesteryl esters. lung cancer; lipidomics; metabolomics; mass spectrometry; metabolism