Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data
Autoři: Koefeler Harald C | Eichmann Thomas O | Ahrends Robert | Bowden John A | Danne-Rasche Niklas | Dennis Edward A | Fedorova Maria | Griffiths William J | Han Xianlin | Hartler Juergen | Holčapek Michal | Jirásko Robert | Koelmel Jeremy P | Ejsing Christer S | Liebisch Gerhard | Ni Zhixu | O'Donnell Valerie B | Quehenberger Oswald | Schwudke Dominik | Shevchenko Andrej | Wakelam Michael J. O | Wenk Markus R | Wolrab Denise | Ekroos Kim
Rok: 2021
Druh publikace: článek v odborném periodiku
Název zdroje: Nature Communications
Název nakladatele: Nature Publishing Group
Místo vydání: London
Strana od-do: 4771
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Požadavky na kontrolu kvality pro správnou anotaci lipidomických údajů Automatizovaná anotace lipidů založená na fragmentových iontových hmotnostních spektrech čelí třem hlavním výzvám; izobarické nebo izomerní lipidy z různých tříd často poskytují podobné fragmenty a nelze je jednoznačně porovnat; množství lipidových fragmentů silně závisí na experimentálních podmínkách, které kompromitují jejich podobnost s referenčními spektry; fragmentace spoluizolovaných prekurzorů z různých tříd často poskytuje vysoce spletitá spektra. identifikace; lipidomické údaje
eng Quality control requirements for the correct annotation of lipidomics data Automated lipid species annotation based on fragment ion mass spectra faces three major challenges; isobaric or isomeric lipid species from different classes often yield similar fragments and cannot be unambigiously matched; the abundance of lipid fragments strongly depends on the experimental conditions which compromises their similarity to reference spectra; fragmentation of co-isolated precursors often originating from different classes yields highly convoluted spectra. identification; lipidomics data