Publikace detail

Intra-laboratory comparison of four analytical platforms for lipidomic quantitation using hydrophilic interaction liquid chromatography or supercritical fluid chromatography coupled to quadrupole - time-of-flight mass spectrometry

Rok: 2021

Druh publikace: článek v odborném periodiku

Název zdroje: Talanta

Název nakladatele: Elsevier Science BV

Místo vydání: Amsterdam

Strana od-do: 122367

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	Intralaboratorní srovnání čtyř analytických platforem pro lipidomickou kvantifikaci pomocí hydrofilní interakční kapalinové chromatografie nebo superkritické kapalinové chromatografie spojené s hmotnostní spektrometrií kvadrupól – analyzátor doby letu	Lipidomický výzkum v současné době věnuje značné úsilí harmonizaci, která by měla umožnit generování srovnatelných a přesných kvantitativních lipidomických údajů napříč různými laboratořemi a bez ohledu na použitou platformu založenou na hmotnostní spektrometrii. V současné studii systematicky zkoumáme účinky experimentálního nastavení na kvantitativní lipidomické údaje získané dvěma přístupy k oddělení lipidových tříd, hydrofilní interakční kapalinovou chromatografií (HILIC) a ultra-vysokoúčinnou superkritickou kapalinovou chromatografií (UHPSFC) spojenými se dvěma různými hmotnostními spektrometry kvadrupól – analyzátor dobry letu (QTOF) od stejného dodavatele. Tento přístup je aplikován na měření 268 vzorků lidské plazmy od zdravých dobrovolníků a pacientů s karcinomem ledvin, z nichž vyplývají čtyři soubory údajů. Zkoumáme a vizualizujeme rozdíly mezi těmito soubory dat pomocí multivariačních metod analýzy dat, jako je analýza hlavních komponent (PCA), ortogonální diskriminační analýza částečných nejmenších čtverců (OPLS-DA), krabicové grafy a logaritmické korelace molárních koncentrací jednotlivých druhů lipidů. Výsledky ukazují, že i měření v téže laboratoři pro stejné vzorky za použití různých analytických platforem mohou přinést mírné odchylky ve stanovených molárních koncentracích. Normalizace na referenční vzorek s definovanými koncentracemi lipidů může dále snížit tyto malé rozdíly, což vede k vysoce homogenním molárním koncentracím jednotlivých lipidů. Tato strategie naznačuje potenciální přístup k vykazování srovnatelných kvantitativních výsledků nezávislý na kvantitativním přístupu a použitém hmotnostním spektrometru, což je důležité pro širší přijetí lipidomických údajů v různých biomarkerových mezilaboratorních studiích a kruhových studiích.	Hydrofilní interakční kapalinová chromatografie; Superkritická kapalinová chromatografie; Hmotnostní spektrometrie; Lipidomika; Kvantifikace; Plazma; Normalizace
eng	Intra-laboratory comparison of four analytical platforms for lipidomic quantitation using hydrophilic interaction liquid chromatography or supercritical fluid chromatography coupled to quadrupole - time-of-flight mass spectrometry	The lipidomic research is currently devoting considerable effort to the harmonization that should enable the generation of comparable and accurate quantitative lipidomic data across different laboratories and regardless of the mass spectrometry-based platform used. In the present study, we systematically investigate the effects of the experimental setup on quantitative lipidomics data obtained by two lipid class separation approaches, hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC) and ultrahigh-performance supercritical fluid chromatography (UHPSFC), coupled to two different quadrupole - time of flight (QTOF) mass spectrometers from the same vendor. This approach is applied for measurements of 268 human plasma samples of healthy volunteers and renal cell carcinoma patients resulting in four data sets. We investigate and visualize differences among these data sets by multivariate data analysis methods, such as principal component analysis (PCA), orthogonal partial least square discriminant analysis (OPLS-DA), box plots, and logarithmic correlations of molar concentrations of individual lipid species. The results indicate that even measurements in the same laboratory for the same samples using different analytical platforms may yield slight variations in the molar concentrations determined. The normalization to a reference sample with defined lipid concentrations can further diminish these small differences, resulting in highly homogenous molar concentrations of individual lipid species. This strategy indicates a potential approach towards the reporting of comparable quantitative results independent from the quantitative approach and mass spectrometer used, which is important for a wider acceptance of lipidomics data in various biomarker inter-laboratory studies and ring trials.	Hydrophilic interaction liquid chromatography; Supercritical fluid chromatography; Mass spectrometry; Lipidomics; Quantitation; Plasma; Normalization

Search

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Katedry

Ústavy a pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte