Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate
Autoři: Smělá Denisa | Zelinková Eliška | Řehulka Pavel | Bílková Zuzana | Kupčík Rudolf
Rok: 2022
Druh publikace: článek v odborném periodiku
Název zdroje: International Journal of Molecular Sciences
Název nakladatele: MDPI
Místo vydání: BASEL
Strana od-do: 8848
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze Extrakce miRNA z buněčného lyzátu bez fenol/chloroformu s využitím nosiče na bázi TiO2 Ačkoliv jsou microRNA považovány za excelentní biomarkery pro řadu onemocnění, jejich izolace má stále řadu limitací. V této studii jsme se zaměřili na vývoj nové metody izolace RNA, která by některé z těchto limitů pomohla překonat. V této práce je uvedena nová, ekonomicky dostupná metoda izolace RNA, která nevyužívá systému fenol/chloroform. RNA je extrahována z buněčného lyzátu pomocí systému isopropanol/voda/NaCl, který je následován extrakcí na pevnou fázi s využitím TiO2 mikrosfér. Je zde také popsán vliv pH na selektivitu TiO2 mikrosfér k různým velikostem RNA molekul. Pomocí úpravy vazebných podmínek je možné regulovat, jaké rozmezí velikostí RNA molekul bude během extrakce na pevnou fázi ze vzorku izolováno. miRNA izolace; TiO2; extrakce krátkých RNA
eng Phenol/Chloroform-Free TiO2-Based miRNA Extraction from Cell Lysate While microRNAs are considered as excellent biomarkers of various diseases, there are still several remaining challenges regarding their isolation. In this study, we aimed to design a novel RNA isolation method that would help to overcome those challenges. Therefore, we present a novel phenol/chloroform-free, low-cost method for miRNA extraction. Within this method, RNA is extracted from cell lysate with an isopropanol/water/NaCl system, followed by solid-phase extraction using TiO2 microspheres to effectively separate short RNAs from long RNA molecules. We also demonstrated the pH-dependent selectivity of TiO2 microspheres towards different sizes of RNA. We were able to regulate the size range of extracted RNAs with simple adjustments in binding conditions used during the solid-phase extraction. miRNA isolation; TiO2; phenol/chloroform-free; short RNA extraction