Přejít k hlavnímu obsahu

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

HYDROFILNÍ INTERAKČNÍ KAPALINOVÁ CHROMATOGRAFIE VE SPOJENÍ S HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIÍ PRO ROZLIŠOVÁNÍ IZOMERNÍCH TŘÍD SFINGOLIPIDŮ V LIDSKÉ PLAZMĚ A BUNĚČNÝCH LINIÍCH
Rok: 2023
Druh publikace: ostatní - přednáška nebo poster
Strana od-do: nestránkováno
Tituly:
Jazyk Název Abstrakt Klíčová slova
cze HYDROFILNÍ INTERAKČNÍ KAPALINOVÁ CHROMATOGRAFIE VE SPOJENÍ S HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIÍ PRO ROZLIŠOVÁNÍ IZOMERNÍCH TŘÍD SFINGOLIPIDŮ V LIDSKÉ PLAZMĚ A BUNĚČNÝCH LINIÍCH Lipidomika je samostatnou oblastí metabolomiky, která se zaměřuje na analýzu lipidů izolovaných z buněk, tělních tekutin, tkání a dalších biologických materiálů. Lipidy jsou důležité endogenní biomolekuly a podílejí se na mnoha biochemických procesech ve všech eukaryotických organismech. Sfingolipidy obsahují sfingoidní báze a v závislosti na polaritě různých dalších substitucí jsou rozděleny na polární a nepolární třídy. V poslední době byl u nádorových onemocnění pozorován změněný metabolismus sfingolipidů, a proto se jejich analýza stává stále populárnější s cílem nalézt potenciální nádorové biomarkery. Avšak je zapotřebí použít robustní a vysoce účinnou metodu k oddělení jednotlivých tříd sfingolipidů a generování spolehlivých dat v rámci měření velkých klinických kohort. V naší práci byla vyvinuta HILIC/MS metoda pro identifikaci a kvantifikaci široké škály sfingolipidů ve vzorcích plazmy a buněčných linií. Optimalizace chromatografických podmínek zahrnovala výběr kolony, složení mobilních fází, vhodný gradient, průtok mobilních fází a koncentraci pufru za účelem dosažení nejlepšího chromatografického rozlišení. Nejlepší rozlišení poskytla kolona Acquity UPLC BEH HILIC (150 x 2.1 mm; 1.7 μm). Zvláštní pozornost byla věnována rozlišení izomerních tříd, například glukosylceramidů od galaktosylceramidů a laktosylceramidů od digalaktosylceramidů. Optimalizovanou metodou bylo identifikováno více než 100 sfingolipidů z 11 lipidových tříd v plazmě i buněčných liniích na základě jejich retenčního času, vysoké přesnosti hmotnosti a fragmentačního chování MS/MS.