Publikace detail

HILIC/MS quantitation of low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum: Dysregulation in pancreatic cancer

Rok: 2024

Druh publikace: článek v odborném periodiku

Název zdroje: Analytica Chimica Acta

Strana od-do: 342144

Tituly:

Jazyk	Název	Abstrakt	Klíčová slova
cze	HILIC/MS kvantifikace zastoupených fosfolipidů a sfingolipidů v lidské plazmě a séru: Dysregulace při rakovině slinivky břišní.	Byla vyvinuta nová metoda kapalinové chromatografie s hydrofilní interakcí ve spojení s hmotnostní spektrometrií (HILIC/MS) pro nízko zastoupené fosfolipidy a sfingolipidy v lidské plazmě a séru. Optimalizovaná metoda zahrnuje použití kolony Cogent Silica typu C hydride, jednoduchou přípravu vzorků pomocí precipitace proteinů a odstranění vysoce zastoupených lipidových tříd pomocí postkolonového ventilu směřujícího odpad během dvou eluačních oken. Metoda umožňuje vysoce spolehlivou a citlivou identifikaci nízko zastoupených lipidových tříd v lidské plazmě (246 lipidových druhů z 24 lipidových podtříd) na základě přesnosti hmoty a závislostí retence v obou polaritních režimech. Kvantifikace byla validována pomocí dvou interních standardů (pokud jsou k dispozici) pro každou lipidovou třídu a aplikována na vzorky plazmy a séra získané od pacientů s duktálním adenokarcinomem slinivky (PDAC), zdravých kontrol a vzorků NIST SRM 1950. Multivariační analýza dat, následovaná různými statistickými projekčními metodami, byla použita k určení nejvíce dysregulovaných lipidů. Významné snížení bylo pozorováno u lysofosfolipidů s mastnými kyselinami o složení 16:0, 18:0, 18:1 a 18:2. U fosfatidylethanolaminů (PE) byly zaznamenány odlišné trendy v závislosti na typu vazby mastných kyselin: většina PE s acylovými vazbami byla zvýšena, zatímco etherové/plasmenylové PE byly sníženy. V kategorii sfingolipidů byly sfingolipidy s velmi dlouhými N-acylovými řetězci sníženy, zatímco sfingolipidy s kratšími N-acylovými řetězci byly zvýšeny u PDAC. Tyto změny byly konzistentně pozorovány u různých tříd sfingolipidů, od ceramidů po glycosfingolipidy, což naznačuje možnou metabolickou poruchu v biosyntéze ceramidů způsobenou PDAC.	HILIC/MS; fosfolipidy; sfingolipidy; Lidská plazma a sérum; Rakovina slinivky břišní
eng	HILIC/MS quantitation of low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum: Dysregulation in pancreatic cancer	A new hydrophilic interaction liquid chromatography - mass spectrometry method is developed for low-abundant phospholipids and sphingolipids in human plasma and serum. The optimized method involves the Cogent Silica type C hydride column, the simple sample preparation by protein precipitation, and the removal of highly abundant lipid classes using the postcolumn valve directed to waste during two elution windows. The method allows a highly confident and sensitive identification of low-abundant lipid classes in human plasma (246 lipid species from 24 lipid subclasses) based on mass accuracy and retention dependencies in both polarity modes. The method is validated for quantitation using two internal standards (if available) for each lipid class and applied to human plasma and serum samples obtained from patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), healthy controls, and NIST SRM 1950. Multivariate data analysis followed by various statistical projection methods is used to determine the most dysregulated lipids. Significant downregulation is observed for lysophospholipids with fatty acyl composition 16:0, 18:0, 18:1, and 18:2. Distinct trends are observed for phosphatidylethanolamines (PE) in relation to the bonding type of fatty acyls, where most PE with acyl bonds are upregulated, while ether/plasmenyl PE are downregulated. For the sphingolipid category, sphingolipids with very long N-acyl chains are downregulated, while sphingolipids with shorter N-acyl chains were upregulated in PDAC. These changes are consistently observed for various classes of sphingolipids, ranging from ceramides to glycosphingolipids, indicating a possible metabolic disorder in ceramide biosynthesis caused by PDAC.	HILIC/MS; Phospholipids; Sphingolipids; Human plasma and serum; Pancreatic cancer

Vyhledávání

Přihlášení pro studenty

Přihlášení pro zaměstnance

Publikace detail

Katedry

Ústavy a pracoviště

Jak nás najdete?

Služby

Často hledáte