Prospektivní studie na včasnou detekci karcinomu pankreatu a sledování průběhu léčby na základě lipidomického profilování hmotnostní spektrometrií
Poskytovatel: Ministerstvo zdravotnictví
Program: Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
Období realizace: 01.05.21 - 31.12.24
Pracoviště:
Fakulta chemicko-technologická - Katedra analytické chemie
Hlavní řešitel: Holčapek Michal
Popis:
Tento projekt je zaměřen na analýzu lipidomického složení krevního séra a nádorových tkání pacientů s karcinomem pankreatu ve srovnání se zdravými kontrolami. Prospektivní sběr vzorků séra a tkání společně se sběrem klinických informací a měřením základních klinických parametrů bude probíhat ve FN Olomouc, FN Hradec Králové a na Lékařské fakultě Univerzity Palackého v Olomouci. Kromě toho bude využita i sada vzorků z biobanky FN Olomouc za účelem optimalizace analytické metodologie pro lipidomickou analýzu, která bude provedena na Univerzitě Pardubice s cílem stanovení molárních koncentrací minimálně 200 lipidů z 5 kategorií lipidů (fosfolipidy, sfingolipidy, glycerolipidy, steroly a mastné kyseliny). Celý pracovní postup bude optimalizován pro budoucí rutinní využití v klinické laboratoři, tedy s využitím nízkorozlišujícího hmotnostního spektrometru typu trojitého kvadrupólu, který se dnes již stává běžnou výbavou klinických laboratoří. Pomocí vícerozměrné analýzy dat budou vytvořeny statistické modely pro rozlišení skupin pacientů od zdravých kontrol včetně stanovení správnosti metody, sensitivity a specificity. Dalším úkolem bude sledování průběhu léčby v korelaci s lipidomickým profilem séra pacientů. Všechna získaná klinická a analytická data budou společně vyhodnocena s použitím moderních bioinformatických postupů s cílem nalezení nejvíce dysregulovaných lipidů pro karcinom pankreatu, což podle dosavadních výsledků jsou zejména downregulované mononenasycené sfingomyeliny s dlouhým alifatickým řetězcem (SM 41:1, SM 39:1, SM42:1, atd.) a upregulované fosfolipidy a sfingolipidy složené z kombinací 16:0 a 18:1 mastných kyselin. Finálně bude celá metodologie převedena do VFN v Praze, aby se ověřila možnost realizace celého postupu za podmínek klinické laboratoře. Cílem projektu je optimalizace celého postupu od odběru vzorků až po způsob reportování výsledků a příprava metody pro následnou klinickou validaci.
Tento projekt je zaměřen na analýzu lipidomického složení krevního séra a nádorových tkání pacientů s karcinomem pankreatu ve srovnání se zdravými kontrolami. Prospektivní sběr vzorků séra a tkání společně se sběrem klinických informací a měřením základních klinických parametrů bude probíhat ve FN Olomouc, FN Hradec Králové a na Lékařské fakultě Univerzity Palackého v Olomouci. Kromě toho bude využita i sada vzorků z biobanky FN Olomouc za účelem optimalizace analytické metodologie pro lipidomickou analýzu, která bude provedena na Univerzitě Pardubice s cílem stanovení molárních koncentrací minimálně 200 lipidů z 5 kategorií lipidů (fosfolipidy, sfingolipidy, glycerolipidy, steroly a mastné kyseliny). Celý pracovní postup bude optimalizován pro budoucí rutinní využití v klinické laboratoři, tedy s využitím nízkorozlišujícího hmotnostního spektrometru typu trojitého kvadrupólu, který se dnes již stává běžnou výbavou klinických laboratoří. Pomocí vícerozměrné analýzy dat budou vytvořeny statistické modely pro rozlišení skupin pacientů od zdravých kontrol včetně stanovení správnosti metody, sensitivity a specificity. Dalším úkolem bude sledování průběhu léčby v korelaci s lipidomickým profilem séra pacientů. Všechna získaná klinická a analytická data budou společně vyhodnocena s použitím moderních bioinformatických postupů s cílem nalezení nejvíce dysregulovaných lipidů pro karcinom pankreatu, což podle dosavadních výsledků jsou zejména downregulované mononenasycené sfingomyeliny s dlouhým alifatickým řetězcem (SM 41:1, SM 39:1, SM42:1, atd.) a upregulované fosfolipidy a sfingolipidy složené z kombinací 16:0 a 18:1 mastných kyselin. Finálně bude celá metodologie převedena do VFN v Praze, aby se ověřila možnost realizace celého postupu za podmínek klinické laboratoře. Cílem projektu je optimalizace celého postupu od odběru vzorků až po způsob reportování výsledků a příprava metody pro následnou klinickou validaci.
