Určování polohy dvojných vazeb v lipidech u nádorových onemocnění
Poskytovatel: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program: Operační program Jan Amos Komenský - výzkum
Období realizace: 01.07.26 - 30.06.28
Pracoviště:
Fakulta chemicko-technologická - Katedra analytické chemie
Hlavní řešitel: Lásko ZuzanaSpoluřešitelé: Holčapek Michal | Jirásko Robert | Zhao Laiyu | Dubská Lenka
Popis:
Lipidy jsou klíčovou součástí buněčných membrán a metabolických drah a jejich struktura zásadně ovlivňuje jejich funkci. Rutinní lipidomické metody založené na spojení kapalinové chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií však často neposkytují dostatečnou strukturní informaci pro nenasycené lipidy a neumožňují spolehlivé rozlišení izomerů lišících se polohou dvojných vazeb. Přitom právě poloha dvojné vazby patří dnes k nejdůležitějším sledovaným strukturním znakům v lipidomice, mimo jiné proto, že u některých nádorových onemocnění byly popsány neobvyklé polohy dvojných vazeb v acylových/alkylových řetězcích lipidů. Cílem projektu je vyvinout metodiku kombinující chromatografickou separaci s online Paternò–Büchi reakcí a hmotnostní detekcí pro určení polohy dvojných vazeb u vybraných tříd lipidů a ověřit její přínos na biologických vzorcích. Součástí projektu bude také vývoj a testování modulu pro automatizovanou interpretaci získaných dat.
Lipidy jsou klíčovou součástí buněčných membrán a metabolických drah a jejich struktura zásadně ovlivňuje jejich funkci. Rutinní lipidomické metody založené na spojení kapalinové chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií však často neposkytují dostatečnou strukturní informaci pro nenasycené lipidy a neumožňují spolehlivé rozlišení izomerů lišících se polohou dvojných vazeb. Přitom právě poloha dvojné vazby patří dnes k nejdůležitějším sledovaným strukturním znakům v lipidomice, mimo jiné proto, že u některých nádorových onemocnění byly popsány neobvyklé polohy dvojných vazeb v acylových/alkylových řetězcích lipidů. Cílem projektu je vyvinout metodiku kombinující chromatografickou separaci s online Paternò–Büchi reakcí a hmotnostní detekcí pro určení polohy dvojných vazeb u vybraných tříd lipidů a ověřit její přínos na biologických vzorcích. Součástí projektu bude také vývoj a testování modulu pro automatizovanou interpretaci získaných dat.
